在生產過程中，柔性印制電路的處理和清洗比處理剛性板更重要(Lexin ，1993) 。不正確的清洗或違反規程的操作可能導致之后產品制造中的失敗，這是由于柔性印制電路所使用材料的敏感性決定的，在制造過程中柔性印制電路扮演著重要的角色。基板受到烘蠟、層壓和電鍍等機械壓力的影響，銅箔也易受敲擊聲、凹痕的影響，而延長部分確保了大的柔韌性。銅箔的機械損傷或加工硬化將減少電路的柔韌壽命。

在制造期間，典型的柔性單面電路少要清洗三次，然而，多基板由于它的復雜性則需要清洗3 -6 次。相比而言，剛性多層印制電路板可能需要同樣數量的清洗次數，但是清洗的程序不同，清洗柔性材料時需要更加小心。即使是受到清洗過程中極輕的壓力，柔性材料的空間穩定性也會受到影響，并且會在z或y 方向導致面板拉長，這取決于壓力的偏向。柔性印制電路板的化學清洗要注意環保。清洗過程包括堿性染浴、徹底的漂洗、微蝕刻和后的清洗。薄膜材料的受損經常發生在面板上架過程中，在池中攪動時、從池中移除架子或沒有搭架子時，以及在清池中表面張力的破壞。

柔性板中的孔一般采用沖孔，這導致了加工成本的增高。鉆孔也是可以的，但這需要專門調整鉆孔參數，從而獲得無涂污的孔壁。鉆孔之后，在有超聲攪拌的水清潔器中去除鉆孔污物。

已經證明，柔性板的大規模生產比剛性印制電路板更便宜。這是因為柔性層壓板使制造商能夠在一個連續的基礎上生產電路，這個過程從層壓板卷材開始，直接可生成成品板。為制造印制電路板并蝕刻柔性印制電路板的一個連續加工示意圖，所有的生產過程在一系列順序放置的機器中完成。絲網印制或許不是這個連續傳送過程的一部分，這造成了在線過程的中斷。